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[IE] Integrative Ecology Lab

Laboratoire d'écologie intégrative

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Les midis numériques
Calendrier des activités

L'objectif de ces rencontres est de présenter des avancées numériques et méthodologiques pertinentes en écologie et évolution. Ces avancées doivent être suffisamment transversales pour permettre de réunir les groupes de recherche en écologie végétale et animale autour d'une même table. La forme choisie est informelle et adaptée au sujet de manière à maximiser les échanges entre les participants.


16 Avril 2018 La reproductibilité en science par Guillaume Blanchet

Cette discussion sera en fait une introduction pour les prochains midi-numériques où nous discuterons différentes approches pratiques pour rendre notre approche à la science reproductible.
Documents à lire: Barba2016.pdf Sandve2013.pdf

26 Mars 2018 Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) par Limoilou Renaud et François Rousseu

Le NDVI est un indice normalisé qui permet de recréer une image de la couverture de la végétation. Par les propriétés de réflexion et d’absorption de certains pigments comme la chlorophylle, on obtient la quantité de « vert » à un endroit donné à partir d'images satellitaires. Or, son extraction est complexe, mais les informations soutirées sont multiples. Voici donc quelques points dont on discutera :

1. Où obtient-on les données brutes;
2. Quels sont les outils et librairies R disponibles pour extraire et manipuler les données;
3. Quelles métriques peut-on extraire des séries temporelles et y a-t-il des méthodes idéales pour le faire (e.g. smooth, filtres, etc.);
4. Que peut-on faire avec cette variable environnementale, avec des exemples de mouflons !

En bref, il s’agit d’une variable essentielle à quiconque s’intéresse aux effets de la phénologie des plantes sur les herbivores, et bien d’autres choses !
Documents à lire:

26 Février 2018 Débogage de code en R par François Rousseu

Au Midi-numérique de cette semaine, je voudrais aborder les différentes stratégies pour déboguer votre code en R, particulièrement en ce qui a trait au débogage des fonctions. Je parlerai également brièvement des différents outils pour étudier la vitesse d'exécution et la performance de votre code.
Documents à lire:

5 Février 2018 Valeurs et les vecteurs propres par Amaël Lesquin


Documents à lire:

brain

The lab meetings
Calendar of weekly meetings

The aim of these lab meetings is to promote discussion among members on all subjects related to ecology, mathematics and computer science. The meetings are intended primarily for lab members, but everyone interested in the subject is welcome! The meetings will be held in D8-0022 at noon on the date in the table:

May 5 Chunchao Zhu To be defined
April 24 Jonathan Brassard To be defined
April 10 Vincent Bellavance
April 3 Madelaine Proulx Macroévolution sur les îles Galapagos
March 27 Mathilde Besson La coévolution, du micro au macro, que savons nous réellement ?
March 20 Idaline Laigle Introduction to C++
March 13 Antoine Hénault Structure des métacommunautés herbacées du mont Sutton
March 6 Gabriel Bergeron Mangal - species interactions database
Februrary 27 Steve Vissault Parallel computing in R
Februrary 20 Dominque Gravel New concepts in metacommunities
Februrary 13 Andréanne Beardsell
Februrary 6 François Massol
January 30 Stéphanie Préfontaine
January 23 Amaël Lesquin